pcr技术的原理类似于dna的天然过程，其特---依赖于靶序列两端互补的寡核苷酸引物，由变性-退火-延伸三个基本反应步骤构成 [2] 。1. 模板dna的变性模板dna经加热至93℃左右一定时间后，使模板dna双链或经pcr扩增形成的双链dna解离，使之成为单链，以便它与引物结合，为下轮反应作准备。2. 模板dna与引物的退火(复性)模板dna经加热变性成单链后，温度降至55℃左右，引物与模板dna单链互补序列配对结合。3. 引物的延伸dna模板-引物结合物在taqdna聚合酶的作用下，以dntp为反应原料，定量pcr仪，靶序列为模板，按碱基配对与半保留原理，合成一条新的与模板dna链互补的半保留链。
重复循环变性-退火-延伸三过程，就可获得更多的“半保留链”，而且这种新链又可成为下次循环的模板。每完成一轮循环需2~4分钟，如此反复进行，每一轮循环所产生的dna均能成为下一轮循环的模板，每一轮循环都使两条人工合成的引物间的dna特异区拷贝数扩增1倍，pcr产物以2的指数形式迅速扩增，经过25~30轮循环后(2~3小时)，理论上可使基因扩增109倍以上，pcr仪报价，实际上一般可达106~107倍。
我们上面提到了反应的原理，pcr仪，由此我们可以简单的推断：温度作为变性-复性-延伸的基本设置，这个是我们需要校准的一个项目。
那么在反应的过程中，温度示值与设定值是否准确，我们需要知道。这是个温度示值误差；因为我们需要升温，进口pcr仪，降温，升温，这是不是涉及到一个速率的问题，升降温的快慢，会直接影响到整个反应过程，所以，升降温速率也是我们需要考量的一个方向。仪器通过加热模块去控制温度，在快速升降温的过程中，仪器不可避免的会先升高/降低温度之后，再达到所设定的问题，这就是温度的过冲，这也是可能也是一个考量的指标。达到一定的温度之后，仪器要平衡一段时间（所设定的时间），而温度平衡的时间和设置的时间，是否一致，也是要考虑的一个方向。不同的dna模板，需要的温度和解链的时间不一样，如果解链的时间没达到要求，dna没有完全变性，在降温复性的过程中，会恢复到天然的状态。
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